W skrócie
- Zadania: Prowadzenie eksperymentów w zakresie ilościowej mikroskopii wysokoprzepustowej i analizy danych.
- Firma: Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN z innowacyjnym podejściem do badań.
- Benefity: Możliwość pracy w dynamicznym zespole oraz rozwój kariery naukowej.
- Pozostałe informacje: Praca w inspirującym środowisku z możliwością rozwoju do 2027 roku.
- Dlaczego ta praca: Zdobądź doświadczenie w badaniach nad odpornością wrodzoną na poziomie komórkowym.
- Kwalifikacje: Doświadczenie w mikroskopii i analizie danych, umiejętność pracy w zespole.
Przewidywane wynagrodzenie mieści się w przedziale 63000 - 77000 zł za rok.
Konkurs na stanowisko adiunkta/adiunktki (post-doc) w zakresie ilościowej mikroskopii wysokoprzepustowej.
Projekt finansowany przez Narodowe Centrum Nauki (NCN). Kierownik projektu: prof. dr hab. inż. Paweł Paszek.
Okres zatrudnienia: do 12 miesięcy (stanowisko dostępne do 31 sierpnia 2027 r.).
Instytucja realizująca: Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN.
Dyscyplina naukowa: Inżynieria Biomedyczna.
Termin składania aplikacji: 8 października 2026.
Planowany termin rozpoczęcia pracy: tak szybko, jak to możliwe.
Słowa kluczowe: mikroskopia wysokoprzepustowa, ilościowa analiza obrazu, mikroskopia żywych komórek, Listeria monocytogenes, interakcje gospodarz–patogen, śledzenie komórek.
Głównym celem projektu jest ilościowe zrozumienie mechanizmów wieloskalowej koordynacji odpowiedzi wrodzonego układu odpornościowego na patogeny bakteryjne na poziomie pojedynczych komórek. Koncentrujemy się na zakażeniach przy niskim, fizjologicznie ważnym poziomie infekcji oraz w zakresie temperatur gorączkowych, czyli w warunkach sprzyjających heterogennym istotach odpowiedzi w populacji zakażonych komórek.
Wykorzystując Listeria monocytogenes (Lm) jako model, badamy, w jaki sposób zmienność odpowiedzi sygnałowych gospodarza oraz zachowania bakterii wpływa na przebieg i wynik zakażenia. Jednym z głównych celów jest zrozumienie, w jaki sposób sygnały pochodzące od patogenu są kodowane w dynamice szlaków sygnałowych gospodarza, w tym NF-κB, oraz jak odpowiedzi te zależą od takich czynników jak gęstość komórek i temperatura.
Będziemy również badać koordynację odpowiedzi na poziomie populacji poprzez sygnalizację parakrynną z udziałem TNFa i IL-1b oraz analizować zmienność interakcji gospodarz–patogen z wykorzystaniem fluorescencyjnych szczepów Lm, w tym szczepów reporterowych wirulencji bakteryjnej.
Do śledzenia odpowiedzi sygnałowych gospodarza oraz dynamiki zakażenia bakteryjnego w pojedynczych makrofagach wykorzystamy wysokoprzepustową mikroskopię fluorescencyjną oraz mikroskopię żywych komórek.
Osoba zatrudniona na stanowisku post-doc będzie prowadzić te eksperymenty oraz ich ilościową analizę z wykorzystaniem oprogramowania Maestro i ShuttleTracker do przetwarzania obrazów i śledzenia obiektów, uzupełnioną analizami w Pythonie obejmującymi przetwarzanie danych, analizę statystyczną i wizualizację wyników.
Do obowiązków osoby zatrudnionej będzie należało:
- Planowanie i prowadzenie eksperymentów z wykorzystaniem mikroskopii wysokoprzepustowej i mikroskopii żywych komórek na makrofagach zakażonych fluorescencyjnie znakowanymi szczepami L. monocytogenes, w tym szczepami reporterowymi.
- Ilościowa analiza interakcji gospodarz–patogen na poziomie pojedynczych komórek, obejmująca m.in. internalizację bakterii, ich wzrost wewnątrzkomórkowy oraz różne wyniki zakażenia.
- Pomiar odpowiedzi komórek gospodarza podczas zakażenia, w tym aktywacja NF-κB, odpowiedzi cytokinowych oraz ekspresji efektorów przeciwdrobnoustrojowych, powiązanie tych odpowiedzi z zachowaniem bakterii oraz wynikiem zakażenia.
- Przetwarzanie obrazów, segmentacja i śledzenie obiektów z wykorzystaniem Maestro i ShuttleTracker, obejmujące segmentację komórek gospodarza, detekcję bakterii oraz ilościowe ekstrakcje cech.
- Optymalizacja i walidacja procedur obrazowania oraz analizy obrazu w celu zapewnienia wiarygodnych i powtarzalnych pomiarów.
- Analiza danych z mikroskopii poklatkowej w celu rekonstrukcji odpowiedzi komórek gospodarza i przebiegu zakażenia w czasie.
- Wykorzystanie języka Python do dalszego przetwarzania danych, analiz statystycznych, wizualizacji oraz integracji pomiarów uzyskanych z obrazowania w różnych warunkach eksperymentalnych.
adiunkta/adiunktki (post-doc) w zakresie ilościowej mikroskopii wysokoprzepustowej in Warsaw – pracodawca: Institute of Fundamental Technological Research Polish Academy of Sciences
Instytut Podstawowych Problemów Techniki Polskiej Akademii Nauk to doskonały pracodawca, oferujący studentom unikalną możliwość pracy nad nowatorskimi projektami w dziedzinie inżynierii materiałowej. Nasza kultura pracy sprzyja innowacjom i współpracy, a także zapewnia wsparcie w rozwoju zawodowym poprzez dostęp do zaawansowanego sprzętu badawczego oraz mentoring ze strony doświadczonych naukowców. Praca w naszym instytucie to nie tylko szansa na zdobycie cennego doświadczenia, ale także możliwość uczestniczenia w przełomowych badaniach, które mogą zmienić przyszłość technologii.
Dane kontaktowe:
Zespół rekrutacyjny Institute of Fundamental Technological Research Polish Academy of Sciences
