Senior Specialist – Research Engineer in the Quantitative Virology Research Group in Kielce

Senior Specialist – Research Engineer in the Quantitative Virology Research Group in Kielce

Kielce Pełny etat 49500 - 60500 zł / rok (szac.) Stacjonarnie
Ł

W skrócie

  • Zadania: Pracuj nad modelowaniem matematycznym i analizą bioinformatyczną w zespole badawczym.
  • Firma: Łukasiewicz–PORT, innowacyjna organizacja badawcza.
  • Benefity: Pełnoetatowe zatrudnienie, opieka medyczna, karta sportowa i dodatkowe dni urlopu.
  • Pozostałe informacje: Możliwość przedłużenia umowy i praca w zielonym kampusie naukowym.
  • Dlaczego ta praca: Zyskaj doświadczenie w badaniach nad HIV i rozwijaj swoje umiejętności w dynamicznym środowisku.
  • Kwalifikacje: Doktorat w naukach obliczeniowych oraz doświadczenie w programowaniu w Pythonie.

Przewidywane wynagrodzenie mieści się w przedziale 49500 - 60500 zł za rok.

Wybrany kandydat będzie pracować w ustalonej laboratorium i dołączy do współpracującej, dynamicznej i rozwijającej się społeczności badaczy w środowisku, które ceni kreatywność i komunikację naukową w Łukasiewicz–PORT. W naszym zespole prowadzimy zarówno eksperymenty laboratoryjne, jak i analizy bioinformatyczne. Kandydat weźmie udział w dyskusjach naukowych z innymi członkami zespołu. Razem z liderem zespołu, kandydat pomoże w szkoleniu nowicjuszy. Ogólnie rzecz biorąc, kandydat będzie miał doskonałą okazję do uczestnictwa w badaniach oraz zdobywania wiedzy i umiejętności dla swojego rozwoju kariery. Ta pozycja oferuje możliwość przedłużenia umowy.

Grupa Badawcza Wirusologii Ilościowej w Łukasiewicz–PORT zaprasza do składania aplikacji na stanowisko postdoktoranckie, które rozpocznie się tak szybko, jak to możliwe. Rekrutujemy kandydatów o szerokich zainteresowaniach badawczych do pracy nad Big Data, badaniami multigenomicznymi i modelowaniem obliczeniowym. Kandydat dołączy do trwających projektów w naszym zespole i będzie prowadzić modelowanie matematyczne/obliczeniowe. Tematy obejmują (1) konstruowanie modeli opartych na głębokim uczeniu do przewidywania molekularnych mikrośrodowisk latentnego rezerwuaru HIV oraz (2) profilowanie krajobrazów wzbogaconych k-merów RNA antysensownego w różnych podtypach HIV-1.

Nasze laboratorium zaproponowało istnienie odmiennych molekularnych mikrośrodowisk w latentnym rezerwuarze HIV, co prowadzi do heterogenicznej natury konfiguracji rezerwuaru. Kandydat zastosuje szereg zestawów danych „omics” wygenerowanych w laboratorium do konstruowania modeli opartych na głębokim uczeniu, umożliwiających klasyfikację i przewidywanie odmiennych mikrośrodowisk oraz poszukiwanie krytycznych atrybutów predykcyjnych definiujących odrębne mikrośrodowiska.

Dodatkowo, nasze laboratorium wcześniej ustanowiło uproszczony pipeline nazwany Narzędziem Rozpoznawania Pochodzenia Patogenów przy użyciu Wzbogaconych K-merów (PORT-EK), które jest podejściem opartym na k-merach, ułatwiającym porównanie różnych zestawów danych multigenomicznych i wykrywanie nadreprezentowanych regionów genomowych związanych z określonymi sekwencjami. Kandydat wzmocni ten pipeline, aby zidentyfikować wzbogacone k-mery przy użyciu antysensownych transkryptów HIV-1 w różnych podtypach. Równolegle kandydat będzie pracować nad eksploracją modeli epidemiologicznych w ramach filodynamiki i fylogeografii oraz ich integracją z modelami genetyki populacyjnej. Zwiększenie wydajności algorytmów integracyjnych i symulacji modeli oraz rozwijanie metod uczenia maszynowego do analizy danych genomowych.

Zakres obowiązków:

  • Modelowanie obliczeniowe/matematyczne i analiza bioinformatyczna

Wymagania:

  • Doktorat w dziedzinie nauk obliczeniowych, matematyki, fizyki lub pokrewnych dziedzin.
  • Co najmniej jeden artykuł naukowy jako pierwszy autor recenzowany przez innych.
  • Znajomość Pythona; znajomość dodatkowych języków programowania (np. R) będzie mile widziana.
  • Oczekiwanie projektów związanych z konstruowaniem modeli opartych na głębokim uczeniu i modelowaniem in silico z zestawami danych metagenomicznych lub zestawami danych genetyki populacyjnej.
  • Osoba zorientowana na zadania i pracująca w zespole.
  • Dobre umiejętności komunikacyjne w języku angielskim (pisane i mówione).

Kandydat musi spełniać wymagania regulaminu projektu NCN, w szczególności uzyskując stopień doktora w roku zatrudnienia w projekcie lub w ciągu 7 lat przed 1 stycznia roku zatrudnienia w projekcie. Okres ten może być przedłużony o czas spędzony w tym okresie na długoterminowym (ponad 90 dni) udokumentowanym zwolnieniu lekarskim lub na świadczeniach rehabilitacyjnych z powodu niezdolności do pracy. Dodatkowo może być przedłużony o liczbę miesięcy spędzonych na urlopie wychowawczym przyznanym zgodnie z Kodeksem Pracy. W przypadku kobiet okres ten może być również przedłużony o 18 miesięcy za każde dziecko urodzone lub adoptowane, jeśli ta metoda uwzględniania przerw w karierze akademickiej jest korzystniejsza.

Oferujemy:

  • Pełnoetatowe zatrudnienie na stanowisku specjalisty.
  • Pracę w organizacji badawczej skoncentrowanej na realizacji innowacyjnych projektów B+R.
  • Współfinansowanie prywatnej opieki medycznej.
  • Współfinansowanie karty sportowej.
  • Możliwość przystąpienia do grupowego ubezpieczenia na życie.
  • Współfinansowanie w ramach Funduszu Świadczeń Socjalnych (na wakacje i Święta).
  • Pracę na terenie zielonego kampusu naukowego.
  • Darmowe miejsce parkingowe.
  • Dodatkowe 10 dni płatnego urlopu rocznie.

Senior Specialist – Research Engineer in the Quantitative Virology Research Group in Kielce – pracodawca: Łukasiewicz – PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologii

Łukasiewicz – PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologii to doskonały pracodawca, który oferuje stabilne zatrudnienie w Wrocławiu oraz atrakcyjne benefity, takie jak dofinansowanie do prywatnej opieki medycznej i karty sportowej. Nasza kultura pracy sprzyja rozwojowi zawodowemu, a zespół księgowy ma możliwość doskonalenia swoich umiejętności w dynamicznym środowisku instytucji badawczej, co czyni nas idealnym miejscem dla osób poszukujących satysfakcjonującej kariery w rachunkowości.

Ł

Dane kontaktowe:

Zespół rekrutacyjny Łukasiewicz – PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologii

Naszym zdaniem te umiejętności pozwolą ci błyszczeć jako Senior Specialist – Research Engineer in the Quantitative Virology Research Group in Kielce

Modelowanie matematyczne
Analiza bioinformatyczna
Programowanie w Pythonie
Znajomość języka R
Budowanie modeli opartych na głębokim uczeniu
Analiza danych genomowych
Umiejętności komunikacyjne w języku angielskim