Senior Specialist – Research Engineer in the Quantitative Virology Research Group in Wrocław

Senior Specialist – Research Engineer in the Quantitative Virology Research Group in Wrocław

Wrocław Pełny etat 67500 - 82500 zł / rok (szac.) Stacjonarnie
Ł

W skrócie

  • Zadania: Pracuj nad modelami uczenia maszynowego i analizą danych genomowych w zespole badawczym.
  • Firma: Dynamiczna grupa badawcza w Łukasiewicz–PORT, skupiająca się na innowacyjnych projektach R&D.
  • Benefity: Prywatna opieka medyczna, karta sportowa, ubezpieczenie grupowe i dodatkowe dni urlopu.
  • Pozostałe informacje: Możliwość przedłużenia umowy i praca w zielonym kampusie naukowym.
  • Dlaczego ta praca: Zyskaj doświadczenie w badaniach nad HIV i rozwijaj swoje umiejętności w dynamicznym środowisku.
  • Kwalifikacje: Doktorat w naukach obliczeniowych oraz doświadczenie w programowaniu w Pythonie.

Przewidywane wynagrodzenie mieści się w przedziale 67500 - 82500 zł za rok.

TRYB PRACY: STACJONARNA

  • Ph.D. in computational science, mathematics, physics or relevant fields.
  • At least one first-author peer-reviewed research article.
  • Working knowledge of Python; knowing additional programming languages (e.g., R) will be appreciated.
  • Anticipating projects related to constructing deep learning-based models and in silico modeling with metagenomics datasets or with population genetics datasets.
  • Task-oriented person and a team worker.
  • Good communication skills in English (written and spoken).

Kandydat musi spełniać wymagania regulaminu projektu NCN, w szczególności uzyskując stopień doktora w roku zatrudnienia w projekcie lub w ciągu 7 lat przed 1 stycznia roku zatrudnienia w projekcie. Okres ten może być wydłużony o czas spędzony w tym okresie na długoterminowym (ponad 90 dni) udokumentowanym zwolnieniu lekarskim lub na świadczeniach rehabilitacyjnych z powodu niezdolności do pracy. Dodatkowo może być wydłużony o liczbę miesięcy spędzonych na urlopie wychowawczym przyznanym na podstawie Kodeksu pracy. W przypadku kobiet okres ten może być również wydłużony o 18 miesięcy na każde urodzone lub adoptowane dziecko, jeśli ta metoda uwzględniania przerw w karierze akademickiej jest korzystniejsza.

Wybrany kandydat będzie pracować w uznanym laboratorium i dołączy do współpracującej, dynamicznej i rozwijającej się społeczności badaczy w środowisku, które ceni kreatywność i komunikację naukową w Łukasiewicz–PORT. W naszym zespole prowadzimy zarówno eksperymenty laboratoryjne, jak i analizy bioinformatyczne w suchym laboratorium. Kandydat weźmie udział w dyskusjach naukowych z innymi członkami zespołu. Razem z liderem zespołu kandydat pomoże w szkoleniu nowicjuszy. Ogólnie rzecz biorąc, kandydat będzie miał doskonałą okazję do uczestnictwa w badaniach oraz zdobywania wiedzy i umiejętności dla swojego rozwoju kariery. To stanowisko oferuje możliwość przedłużenia umowy.

Grupa Badawcza Wirusologii Ilościowej w Łukasiewicz–PORT zaprasza do składania aplikacji na stanowisko postdoktoranckie, które rozpocznie się tak szybko, jak to możliwe. Rekrutujemy kandydatów o szerokich zainteresowaniach badawczych do pracy nad Big Data, badaniami multigenomicznymi i modelowaniem obliczeniowym.

Kandydat dołączy do trwających projektów w naszym zespole i wykona modelowanie matematyczne/obliczeniowe. Tematy obejmują (1) konstruowanie modeli opartych na głębokim uczeniu do przewidywania molekularnych mikrośrodowisk latentnego rezerwuaru HIV oraz (2) profilowanie krajobrazów wzbogaconych k-merów RNA antysensownego w różnych podtypach HIV-1.

Nasze laboratorium zaproponowało istnienie odmiennych molekularnych mikrośrodowisk w latentnym rezerwuarze HIV, co prowadzi do heterogenicznej natury konfiguracji rezerwuaru. Kandydat zastosuje szereg zestawów danych „omics” generowanych w laboratorium do konstruowania modeli opartych na głębokim uczeniu, umożliwiających klasyfikację i przewidywanie odmiennych mikrośrodowisk oraz poszukiwanie krytycznych atrybutów predykcyjnych w definiowaniu odmiennych mikrośrodowisk.

Dodatkowo nasze laboratorium wcześniej ustanowiło uproszczony pipeline nazwany Narzędzie Rozpoznawania Pochodzenia Patogenów przy użyciu Wzbogaconych K-merów (PORT-EK), które jest podejściem opartym na k-merach, ułatwiającym porównanie różnych zestawów danych multigenomicznych i wykrywanie nadreprezentowanych regionów genomowych (tj. k-mery) związanych z określonymi sekwencjami. Kandydat dodatkowo wzmocni pipeline w celu identyfikacji wzbogaconych k-merów przy użyciu antysensownych transkryptów HIV-1 w różnych podtypach. Równolegle kandydat będzie pracować nad badaniem modeli epidemiologicznych w ramach filodynamiki i fylogeografii oraz ich integracją z modelami genetyki populacyjnej. Zwiększenie wydajności algorytmów integracyjnych i symulacji modeli oraz rozwijanie metod uczenia maszynowego do analizy danych genomowych.

Modelowanie obliczeniowe/matematyczne i analiza bioinformatyczna.

Pełnoetatowe zatrudnienie na stanowisku Senior Specialist.

Praca w organizacji badawczej skoncentrowanej na realizacji innowacyjnych projektów B+R.

Współfinansowanie prywatnej opieki medycznej.

Współfinansowanie karty sportowej.

Możliwość przystąpienia do grupowego ubezpieczenia na życie.

Współfinansowanie w ramach Funduszu Świadczeń Socjalnych (na wakacje i święta).

Praca na terenie zielonego kampusu naukowego.

Darmowe miejsce parkingowe.

Dodatkowe 10 dni płatnego urlopu rocznie dla pracowników działu badawczego.

Senior Specialist – Research Engineer in the Quantitative Virology Research Group in Wrocław – pracodawca: Łukasiewicz – PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologii

Łukasiewicz – PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologii to doskonały pracodawca, który oferuje stabilne zatrudnienie w Wrocławiu oraz atrakcyjne benefity, takie jak dofinansowanie do prywatnej opieki medycznej i karty sportowej. Nasza kultura pracy sprzyja rozwojowi zawodowemu, a zespół księgowy ma możliwość doskonalenia swoich umiejętności w dynamicznym środowisku instytucji badawczej, co czyni nas idealnym miejscem dla osób poszukujących satysfakcjonującej kariery w rachunkowości.

Ł

Dane kontaktowe:

Zespół rekrutacyjny Łukasiewicz – PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologii

Naszym zdaniem te umiejętności pozwolą ci błyszczeć jako Senior Specialist – Research Engineer in the Quantitative Virology Research Group in Wrocław

Doktorat w dziedzinie nauk obliczeniowych, matematyki, fizyki lub pokrewnych
Znajomość Pythona
Znajomość dodatkowych języków programowania (np. R)
Modelowanie oparte na głębokim uczeniu
Analiza danych metagenomicznych
Analiza danych genetyki populacyjnej
Umiejętności komunikacyjne w języku angielskim (pisemne i ustne)