W skrócie
- Zadania: Pracuj nad modelowaniem matematycznym i analizą bioinformatyczną w zespole badawczym.
- Firma: Łukasiewicz–PORT, innowacyjna organizacja badawcza.
- Benefity: Pełnoetatowe zatrudnienie, opieka medyczna, karta sportowa i dodatkowe dni urlopu.
- Pozostałe informacje: Możliwość pracy w zielonym kampusie naukowym z doskonałymi możliwościami rozwoju kariery.
- Dlaczego ta praca: Zyskaj doświadczenie w badaniach nad HIV i rozwijaj swoje umiejętności w dynamicznym środowisku.
- Kwalifikacje: Doktorat w naukach obliczeniowych oraz doświadczenie w programowaniu w Pythonie.
Przewidywane wynagrodzenie mieści się w przedziale 49500 - 60500 zł za rok.
Wybrany kandydat będzie pracować w ustalonej laboratorium i dołączy do współpracy, dynamicznej i rozwijającej się społeczności badaczy w środowisku, które ceni kreatywność i komunikację naukową w Łukasiewicz–PORT. W naszym zespole prowadzimy zarówno eksperymenty laboratoryjne, jak i analizy bioinformatyczne. Kandydat weźmie udział w dyskusjach naukowych z innymi członkami zespołu. Razem z liderem zespołu, kandydat pomoże w szkoleniu nowicjuszy. Ogólnie rzecz biorąc, kandydat będzie miał doskonałą okazję do uczestnictwa w badaniach oraz zdobywania wiedzy i umiejętności dla swojego rozwoju kariery. Ta pozycja oferuje możliwość przedłużenia umowy.
Grupa Badawcza Wirusologii Ilościowej w Łukasiewicz–PORT zaprasza do składania aplikacji na stanowisko postdoktoranckie, które rozpocznie się tak szybko, jak to możliwe. Rekrutujemy kandydatów o szerokich zainteresowaniach badawczych do pracy nad Big Data, badaniami multigenomicznymi i modelowaniem obliczeniowym. Kandydat dołączy do trwających projektów w naszym zespole i będzie prowadzić modelowanie matematyczne/obliczeniowe. Tematy obejmują (1) konstruowanie modeli opartych na głębokim uczeniu do przewidywania molekularnych mikrośrodowisk latentnego rezerwuaru HIV oraz (2) profilowanie krajobrazów wzbogaconych k-merów RNA antysensownego w różnych podtypach HIV-1.
Nasze laboratorium zaproponowało istnienie odmiennych molekularnych mikrośrodowisk w latentnym rezerwuarze HIV, co prowadzi do heterogenicznej natury konfiguracji rezerwuaru. Kandydat zastosuje szereg zestawów danych „omics” wygenerowanych w laboratorium do konstruowania modeli opartych na głębokim uczeniu, umożliwiających klasyfikację i przewidywanie odmiennych mikrośrodowisk oraz poszukiwanie krytycznych atrybutów predykcyjnych w definiowaniu odmiennych mikrośrodowisk.
Dodatkowo, nasze laboratorium wcześniej ustanowiło uproszczony pipeline nazwany Narzędziem Rozpoznawania Pochodzenia Patogenów przy użyciu Wzbogaconych K-merów (PORT-EK), który jest podejściem opartym na k-merach, ułatwiającym porównanie różnych zestawów danych multigenomicznych i wykrywanie nadreprezentowanych regionów genomowych związanych z określonymi sekwencjami. Kandydat wzmocni pipeline w celu identyfikacji wzbogaconych k-merów przy użyciu antysensownych transkryptów HIV-1 w różnych podtypach. Równolegle, kandydat będzie pracować nad eksploracją modeli epidemiologicznych w ramach filodynamiki i filogeografii oraz ich integracją z modelami genetyki populacyjnej. Zwiększenie wydajności algorytmów integracyjnych i symulacji modeli oraz rozwijanie metod uczenia maszynowego do analizy danych genomowych.
Zakres obowiązków:
- Modelowanie obliczeniowe/matematyczne i analiza bioinformatyczna
Wymagania:
- Doktorat w dziedzinie nauk obliczeniowych, matematyki, fizyki lub pokrewnych dziedzin.
- Co najmniej jeden artykuł badawczy jako pierwszy autor recenzowany przez ekspertów.
- Znajomość Pythona; znajomość dodatkowych języków programowania (np. R) będzie mile widziana.
- Oczekiwanie projektów związanych z konstruowaniem modeli opartych na głębokim uczeniu i modelowaniem in silico z zestawami danych metagenomicznych lub z zestawami danych genetyki populacyjnej.
- Osoba zorientowana na zadania i pracująca w zespole.
- Dobre umiejętności komunikacyjne w języku angielskim (pisane i mówione).
Kandydat musi spełniać wymagania regulaminu projektu NCN, w szczególności uzyskując stopień doktora w roku zatrudnienia w projekcie lub w ciągu 7 lat przed 1 stycznia roku zatrudnienia w projekcie. Okres ten może być przedłużony o czas spędzony w tym okresie na długoterminowym (ponad 90 dni) udokumentowanym zwolnieniu lekarskim lub na świadczeniach rehabilitacyjnych z powodu niezdolności do pracy. Dodatkowo, może być przedłużony o liczbę miesięcy spędzonych na urlopie wychowawczym przyznanym zgodnie z Kodeksem pracy. W przypadku kobiet, ten okres może być również przedłużony o 18 miesięcy na każde dziecko urodzone lub adoptowane, jeśli ta metoda uwzględniania przerw w karierze akademickiej jest korzystniejsza.
Oferujemy:
- Pełnoetatowe zatrudnienie na stanowisku specjalisty.
- Pracę w organizacji badawczej skoncentrowanej na realizacji innowacyjnych projektów B+R.
- Współfinansowanie prywatnej opieki medycznej.
- Współfinansowanie karty sportowej.
- Możliwość przystąpienia do grupowego ubezpieczenia na życie.
- Współfinansowanie w ramach Funduszu Świadczeń Socjalnych (na wakacje i Święta).
- Pracę na terenie zielonego kampusu naukowego.
- Darmowe miejsce parkingowe.
- Dodatkowe 10 dni płatnego urlopu rocznie.
Senior Specialist – Research Engineer in the Quantitative Virology Research Group in Kielce – pracodawca: Lukasiewicz
Jako Specjalista/Specjalistka ds. zarządzania wiedzą w naszym Instytucie, będziesz częścią dynamicznego zespołu, który ceni sobie elastyczność i rozwój zawodowy. Oferujemy atrakcyjny pakiet benefitów, w tym prywatną opiekę medyczną oraz dofinansowanie działalności rekreacyjnej, co sprawia, że praca w naszym zespole to nie tylko obowiązki, ale także możliwość dbania o równowagę między życiem zawodowym a prywatnym. Nasza kultura pracy sprzyja innowacyjności i współpracy, co czyni nas doskonałym miejscem dla osób poszukujących satysfakcjonującego zatrudnienia.
